高等职业技术学院是文山学院2019年5月成立的专门举办全日制专科的二级学院，2019年7月招生，在文山州职教园区办学，由文山学院统一管理，文山学院、园区学校和行业企业有丰富经验的教师共同承担课程教学、实践教学和学生管理工作。

高等职业技术学院现设有护理、工程测量技术、中药学、中草药栽培与加工技术、有色金属智能冶金技术、食品检验检测技术、环境工程技术、药品生产技术、学前教育9个专科专业，有30个教学班1108名学生，以省内生源为主，兼招四川、贵州、广西、湖南等周边省区学生。

高等职业技术学院主动对接文山州以三七为重点的中医药产业、以绿色铝材为支撑的矿电产业、以康养为特色的旅游业、以绿色食品为代表的现代农业四大重点产业，顺应国家重视高等职业教育的机遇和文山学院建设一流应用型大学的方向，力争为地方经济社会发展培养更多的应用型、复合型、技能型人才。